A Fiocruz Rondônia está engajada na pesquisa e desenvolvimento de tecnologias voltadas para a prestação de serviços em saúde básica, vigilância epidemiológica associada a impactos ambientais, desafios demográficos e questões de fronteira, bem como na criação de produtos e processos para o avanço de novos fármacos ou diagnósticos.
Através de suas linhas de pesquisa, a instituição tem obtido resultados significativos que abordam a necessidade urgente de novas tecnologias e serviços aplicáveis no controle, diagnóstico e tratamento de doenças endêmicas que afetam a região amazônica. Com uma equipe de 19 servidores, incluindo 16 pesquisadores em Saúde Pública, distribuídos em 11 laboratórios, a Fiocruz Rondônia dedica-se ao fortalecimento da pesquisa na Amazônia e à formulação de políticas direcionadas à formação de profissionais da saúde em todos os níveis de atuação.
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